📄 systems biology

Kinome profiling allows examination and prediction of kinase inhibitor cardiotoxicity

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि प्रोटिओमिक किनोम प्रोफाइलिंग को मशीन लर्निंग के साथ एकीकृत करना विशिष्ट ऑफ-टारगेट किनसे जुड़ाव, जैसे कि PDGFRB और EGFR, की पहचान करके किनेज इनहिबिटर कार्डियोटॉक्सिसिटी (हृदय संबंधी विषाक्तता) की भविष्यवाणी करने में सक्षम बनाता है जो प्रतिकूल हृदय संबंधी घटनाओं को संचालित करते हैं।

Tabet, J. S., Joisa, C. U., Jensen, B. C., Gomez, S. M.2026-04-07
📄 systems biology

Integrative Multi-cohort Transcriptomics and Network Pharmacology Analysis Reveals Key Network Nodes and Potential Drug Clues in PCOS Granulosa Cells

यह अध्ययन पीसीओएस (PCOS) ग्रैनुलोसा कोशिकाओं में सीडी44 (CD44) को एक प्रमुख हब जीन के रूप में पहचानने के लिए मल्टी-कोहॉर्ट ट्रांसक्रिप्टोमिक्स और नेटवर्क फार्माकोलॉजी को एकीकृत करता है और विशिष्ट जीन-ड्रग युग्मों, जैसे कि फ्लुफेनामिक एसिड के साथ जीजेए5 (GJA5), को भविष्य के चिकित्सीय विकास के लिए आशाजनक उम्मीदवारों के रूप में प्राथमिकता देता है।

Zhang, X., Fang, J., Liu, Z., Li, S., Jin, F., Guo, L., Qiang, R., Zhu, Y., Hou, T., Li, J., Liu, Y.2026-04-06
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Investigating the dynamics of heat acclimation in pig through transcriptome analysis of blood samples

यह अध्ययन ऊष्मा अनुकूलन (हीट एक्लीमेशन) की विशिष्ट कालिक गतिशीलता को स्पष्ट करने के लिए सुअरों के संपूर्ण रक्त ट्रांसक्रिप्टोम विश्लेषण का उपयोग करता है, जो एक द्विचरणीय प्रतिक्रिया को प्रकट करता है जहाँ अल्पकालिक अनुकूलन प्रतिरक्षा सक्रियण और हीट शॉक प्रोटीन द्वारा संचालित होता है, जबकि दीर्घकालिक अनुकूलन में होमियोथर्मी (homeothermy) को बहाल करने के लिए लिपिड चयापचय और ऑक्सीडेटिव फास्फोरिलीकरण में जटिल चयापचय परिवर्तनों का समावेश होता है।

Huau, G., Liaubet, L., Labrune, Y., Campos, P. H. R. F., Gilbert, H., Renaudeau, D.2026-04-06
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Disentangling the cost of gene expression

यह अध्ययन एक संसाधन प्रतिस्पर्धा मॉडल स्थापित करता है जो जीन अभिव्यक्ति की फिटनेस लागत को राइबोसोम, आरएनए पॉलीमरेज़ और ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर सीमाओं द्वारा संचालित विशिष्ट घटकों में अलग करता है, यह प्रकट करते हुए कि ये लागतें जीन उत्पादों के बजाय स्वयं ट्रांसक्रिप्शन और ट्रांसलेशन प्रक्रियाओं से उत्पन्न होती हैं, जिससे सिंथेटिक बायोलॉजी में जेनेटिक डिज़ाइन को अनुकूलित करने के लिए एक मात्रात्मक ढांचा प्रदान होता है।

Yan, Y., Lin, J.2026-04-02
📄 systems biology

Speed-Dependent Turning Strategies in Quadrupedal Locomotion: Insights from Computational Modeling

यह अध्ययन चतुष्पाद चाल (quadrupedal locomotion) के एक कम्प्यूटेशनल मॉडल का विस्तार करता है ताकि यह प्रदर्शित किया जा सके कि जानवर गति-निर्भर विशिष्ट विषम टर्निंग रणनीतियों का उपयोग करते हैं—विशेष रूप से कम गति पर शरीर का झुकना, मध्यम गति पर पार्श्व बल का अनुप्रयोग, और उच्च गति पर पार्श्व अंग विस्थापन—जिसमें अग्रपाद मुख्य रूप से स्टीयरिंग को संचालित करते हैं जबकि पश्चपाद प्रणोदन और स्थिरता को नियंत्रित करते हैं।

Molkov, Y. I., Mohammed, M. A. Y., Stell, T., Harralson, A., Jeter, R., Rybak, I. A.2026-04-02
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HiMaLAYAS: enrichment-based annotation of hierarchically clustered matrices

हिमालयस (HiMaLAYAS) एक पायथन-आधारित फ्रेमवर्क है जो क्लस्टर्स को सांख्यिकीय इकाइयों के रूप में मानकर जैविक और गैर-जैविक दोनों डोमेन में महत्वपूर्ण एनोटेशन का परीक्षण करने और उन्हें विज़ुअलाइज़ करने के लिए पदानुक्रमित रूप से क्लस्टर किए गए मैट्रिसेस के पोस्ट हॉक एनरिचमेंट-आधारित एनोटेशन को सक्षम बनाता है।

Horecka, I., Rost, H.2026-03-31
📄 systems biology

From the lung to the muscle: Systemic insights from an integrative MultiOmics analysis of harbour porpoises in poor respiratory health

यह अध्ययन श्वसन स्वास्थ्य से समझौता किए गए हार्बर पोर्स (harbour porpoises) पर एक एकीकृत मल्टीओमिक्स (MultiOmics) दृष्टिकोण का उपयोग करता है ताकि फेफड़ों और मांसपेशियों के ऊतकों में प्रतिरक्षा और चयापचय संबंधी अनियमितता के प्रणालीगत आणविक हस्ताक्षरों को प्रकट किया जा सके, जो समुद्री प्रजातियों पर मानवजनित प्रभावों की निगरानी के लिए नवीन बायोमार्कर प्रदान करता है।

Dönmez, E. M., Siebels, B., Drotleff, B., Nissen, P., Derous, D., Fabrizius, A., Siebert, U.2026-03-31
📄 systems biology

Protocol-dependent cardiomyocyte states determine disease modelling capacity of human iPSCs

यह अध्ययन व्यवस्थित रूप से प्रदर्शित करता है कि विभिन्न प्रोटोकॉल के माध्यम से मानव iPSCs को कार्डियोमायोसाइट्स में विभेदित करने से जैविक रूप से अद्वितीय कोशिका अवस्थाएं प्राप्त होती हैं जिनकी रोग-प्रासंगिकता भिन्न होती है, जो अनुकूलित रोग मॉडलिंग के लिए विशिष्ट हृदय संबंधी रोगों की आनुवंशिक संरचनाओं के साथ विशिष्ट विभेदन रणनीतियों को मिलाने के लिए एक ढांचा स्थापित करता है।

Shen, S., Tan, C., Cao, Y., Chow, C. S. Y., Mizikovsky, D., Reid, J., Dingwall, S., Prowse, A., Sun, Y., Wu, Z., Negi, S (…)2026-03-31
📄 systems biology

Competition between mitochondrial and cytosolic ribosomes produces a bistable metabolic switch

यह शोध पत्र प्रदर्शित करता है कि *Saccharomyces cerevisiae* में एक द्वि-स्थिर (bistable) चयापचय स्विच, जो यह निर्धारित करता है कि कोशिकाएं किण्वनकारी "अरेस्टर" (arrestor) या श्वसनकारी "रिकवरर" (recoverer) अवस्था को अपनाती हैं, माइटोकॉन्ड्रियल और साइटोसोलिक राइबोसोम के बीच प्रतिस्पर्धा से उत्पन्न होता है, जहाँ माइटोकॉन्ड्रियल बनाम साइटोप्लाज्मिक प्रोटीन संश्लेषण की सापेक्ष दर इस संरक्षित एपिजेनेटिक संक्रमण के लिए आवश्यक सकारात्मक फीडबैक लूप को नियंत्रित करती है।

Nanda, P., Murray, A. W.2026-03-31
📄 systems biology

A Reproducible Dual-Model Constraint-Based Framework for Exploring Hepatic Energy Metabolism Under Stachys affinis-Derived Short-Chain Fatty Acid Scenarios

यह अध्ययन एक पुनरुत्पादनीय दोहरी-मॉडल बाधा-आधारित ढांचे (dual-model constraint-based framework) का उपयोग करता है यह प्रदर्शित करने के लिए कि *Stachys affinis* से प्राप्त स्टैचियोज-व्युत्पन्न लघु-श्रृंखला फैटी एसिड (short-chain fatty acids) खुराक-निर्भर तरीके से यकृत (hepatic) ATP उत्पादन को महत्वपूर्ण रूप से बढ़ाते हैं, जबकि साथ ही लक्षित मार्ग बहाली (targeted pathway restoration) के माध्यम से Recon3D मॉडल में एक महत्वपूर्ण प्रोपियोनेट कैटाबोलिज्म अंतराल की पहचान और क्रॉस-वैलिडेट करता है।

Nguyen, A. T., Nguyen, B. A.2026-03-30